bsa分析内容全面升级

新的学期开始啦,

图谱君是否是得给自己定个小目标?

比如说BSA拿到10个候选基因!

朝着这个目标,我们的BSA升级啦!

好了,话不多说,

我们来看一下BSA具体升级了哪些内容:

1定位方法的升级:由一种关联分析方法(ED或SNP-index)升级为两种关联分析方法,即SNP-index法和ED法同时进行关联分析,并取交集作为某一性状的候选区域。

升级后优势:提高关联分析准确性的同时,缩小候选区域。

2双标记定位:由SNP为Marker进行关联分析升级为以SNP和InDel两种标记进行关联分析,即实现SNP及InDel双标记定位。

升级后优势:标记类型多,同时能解决某些由片断插入缺失所引发的性状定位类研究。

3候选区域的注释升级:由对样品的候选区域注释(相当于提供样品与参考基因组之间的注释信息)升级为亲本间及混池间的样品注释信息。

升级后优势:参考基因组的性状与所研究的性状有没有区分,这样的信息其实不肯定,比较起来意义不大。与之相比,样品间的注释信息,参考价值更大。

4结果可视化升级:可视化内容由SNP、InDel等标记的可视化升级为标记可视化(SNP及InDel)和关联分析结果可视化(ED和SNP-index),具体详见下图。

升级后优势:信息更全面,结果更直接明朗。

第一圈:染色体坐标,第二圈:基因散布,第三圈:SNP密度散布,

第四圈:ED值散布,第五圈:ΔSNP-index值散布。

以上就是我们本次BSA产品升级的四大方面,如有甚么问题可以留言哦,图谱君期待与您一起探讨!

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